1、一对染色体与另一对形态结构不同的染色体，互称为非同源染色体。

2、各种生物的染色体形态结构不仅是相对稳定的，而且大多数高等生物是二倍体(diploid)，其体细胞内染色体数目一般是成对存在的。这样形态和结构相同的一对染色体，称为同源染色体(homologous chromosome)；同源染色体不仅形态相同，而且它们所含的基因位点也相同。但在许多物种中有一对同源染色体(性染色体)其形态和所含基因位点往往是不同的。而这一对染色体与另一对形态结构不同的染色体，则互称为非同源染色体(non-homologous chromosome)。

3、非同源染色体与同源染色体的区别就在来源上，反应在形态、大小上。