1、含义不同：（1）仇怨意思是仇视憎恨。（2）愁怨意思是忧愁怨恨。

2、出处不同。（1）仇怨出处：《史记·秦始皇本纪》：“秦王之邯郸，诸尝与王生赵时母家有仇怨，皆阬之。”《明史·高杰传》：“杰伏兵要击黄得功於土桥，得功几不免，两镇遂相仇怨。”（2）愁怨出处：《汉书·谷永传》：“峻刑重赋，百姓愁怨。”唐·元稹《莺莺传》：“崔氏宛无难词，然而愁怨之容动人矣。”