马铃薯的虫害主要有地老虎、金针虫、蛴螬、蝼蛄等地下害虫，可在播种前用辛硫磷进行土壤处理。

马铃薯的病害主要有真菌性病害（早疫病、晚疫病），细菌性病害（环腐病、黑茎病）和病毒性病害（x病毒、Y病毒和卷叶病毒）。其防治措施分别为：

细菌性病害的防治：首先应选用轮作3年以上的地块，以无病薯块作种薯，田间发现病株应立即拔出，并用石灰处理土壤，以便杀死土壤残留细菌。

真菌性病害的防治：真菌性病害是靠气流传播，因此防治方法除了用无病薯作种薯外，应注意田间预防，具体操作应根据当地病害发生情况及时施用高效低毒农药，如杀毒矾、代森锰锌、甲霜灵锰锌等交替喷施。一旦田间发现中心病株应及时剔除，并对周围植株连喷杀菌农药3-4次。

病毒病的防治首先应选用抗病毒品种，最好用脱毒种薯生产商品薯，生长期间要控制蚜虫传播病毒，在开花现蕾前发现蚜虫及时喷施抗蚜威等高效低毒杀虫剂，开花后不再防虫，生产种薯时，要全生育期防治蚜虫等昆虫。