申请养殖合作社必须要去相关部门办理防疫合格证、合作社资料、房屋产权证明、经营场所证明、合作社营业执照等。不过不同地方申请养殖合作社的条件有一定差异，可以去当地农业局畜牧部门和当地镇政府农委进行咨询。