辣椒打叉芽通常是辣椒的侧枝长到15公分左右的时候进行，不能在下雨天做该工作，很容易感染其它病害。常用的打叉方法有三主枝整枝打叉、四主枝整枝打叉、多主枝整枝打叉、不规则整枝打叉四种。