根据菌株荚膜抗原（K)结构不同，可将之分为A、B、D、E和F共5种荚膜血清型，常见A、B、D型。B型能引起多种严重疾病，从肺炎猪的肺脏中经常分离到A型毒株，也常分离到D型。依巴氏杆菌的耐热性抗原的不同，将其分为16个血清型，而且各型之间多无交叉保护或保护力不强。但在一定条件下，各种动物之间可发生交叉感染，猪吃了患禽霍乱的死鸡，有的也可感染发病。不过交叉感染一般呈散发，常取慢性经过。