冬瓜黑星病对叶片、茎、果实均会形成危害。因此种植时宜选用抗病品种，将种子用多菌灵浸泡后再播种，定植时采用地膜覆盖，并加强栽培管理。发病后喷施多菌灵或代森猛锌等药剂。