棉花蕾期整枝主要是去叶枝。叶枝生长势强，消耗养分多，加剧营养生长和生殖生长的矛盾。当辨认出果枝和叶枝时，就要把第一果枝以下的叶枝打掉，但要保留主茎下部大叶以维持较大的叶面积，增强光合能力。如遇到缺苗断垄的地方或地头底边，也可以适当留一、二个叶枝，以充分利用空间。其次是抹赘芽。赘芽生长快，消耗养分多，影响蕾铃发育，所以，要及时抹捭。整枝技术有去叶枝、打顶心、打边心、抹赘芽、去无效蕾、剪空枝、打老叶等。

整枝后普遍表现烂铃减少，促进早熟，霜前花产量增加，纤维品质高。因此多数认为棉花整枝不可避免，但也不必过分精细，应根据当地气候、品种等条件，适当加以简化。一般棉田，应打顶和去叶枝;旱薄地棉花，只进行打顶就可以了;多雨，高密度而又旺长的棉花，除了打顶、去叶枝外，还应采取其它整枝措施，或则控制肥水，或则采用化学药剂控制。