1、灵活就业人员医保缴费标准各地不一。《社会保险法》规定，灵活就业人员参加社保，应该按照国家和地方规定缴纳保险费用，分别计入社保统筹基金和个人账户。
2、以北京为例，北京地区的灵活就业参加的社保险种是基本养老保险、基本医疗保险和失业保险三险，三种保险只能是捆绑式参加。北京地区灵活就业人员养老保险和失业保险缴费基数：分为三档，下限是上一年度社平工资的40%，中间档是上一年度社平工资的60%，上限是上一年度社平工资的100%。普通灵活就业人员：养老保险20%，医疗保险7%，失业保险1.2%。
3、根据市劳发2007 164号《西安市灵活就业人员医疗保险试行办法的通知》规定，自由职业者、个体经济组织业主(包括个体工商户)及从业人员和外来务工人员等无档案的灵活就业人员参加医疗保险时，由职介机构协助登记建立医疗保险关系档案后，为其代办医疗保险相关手续。灵活就业人员医疗保险费通过职介机构代征代缴，职介机构应将灵活就业人员医疗保险费缴纳至医疗保险经办机构。