灵活就业医保停保流程：

　　登录南京市医疗保障局，选择“网上办事——个人登录——征缴管理——灵活就业人员中止医疗保险”办理停保手续。

　　拓展阅读：灵活就业医保断缴等待期

　　对中断缴费的灵活就业人员，自第二个自然月起暂时停止享受职工医保待遇。原则上，在3个月内恢复正常缴费的，恢复正常缴费后发生的医疗费用由职工医保基金按规定报销;灵活就业人员超过3个月未缴纳职工医保费，以后重新缴费的，可再次设立不超过3个月的等待期。