南京低风险地区的人员离开南京需要携带48小时核酸检测阴性证明。
根据《新型冠状病毒肺炎防控方案(第九版)》新冠肺炎疫情风险区划定及管控相关要求：
（1）对高风险区实行封控措施，期间“足不出户、上门服务”；（2）对中风险区实行管控措施，期间“人不出区、错峰取物”；（3）对低风险区实行“个人防护，避免聚集”，离开所在城市持48小时核酸检测阴性证明。
拓展阅读：应检尽检与愿检尽检的区别
应检尽检包括患者（确诊患者、无症状感染者）、发热门诊就诊人员、新住院人员及陪护，还有重点地区进口冷链、来人以及疫情防控人员如医疗卫生机构人员，从事非冷链物品装卸、运输、消毒等人员。由人员所在的主管部门进行通知，到指定的采样点进行检测。
愿检尽检人群主要是自己需要到外地提供核酸证明的人，还有怀疑自己有接触风险需要进行排查的人员。需要到有资质的能收费的检测机构进行检测，这个是收费的。
