从上海乘坐高铁经过苏州到南京的人员需要提供48小时内核酸检测阴性证明，具体的依据如下：

　　根据南京市疾控中心2022年2月14日发布的《苏州检出多例阳性!南京疾控提醒：加强防护，不可大意!》的通知可知：

　　1、所有来自或途经苏州市人员，需提供48小时内核酸检测阴性证明，并在抵宁后尽快且不得超过12小时向所在社区(村)、单位(或所住宾馆)报告，配合落实健康监测、核酸检测等疫情防控措施。

　　2、2022年1月31日以来，对与苏州市确诊病例(含无症状感染者)有轨迹交叉、有中高风险地区旅居史的人员，积极配合落实集中医学观察等管控措施。

　　3、2022年1月31日以来，有苏州市工业园区、吴中区、姑苏区、吴江区等县区旅居史的人员，进行7天(自离开苏州市之日起)严格健康监测，强化核酸检测(第1、3、7天各检测1次)(7天3检)。有苏州其他低风险地区旅居史的人员，需提供48小时内核酸检测阴性证明，并在进入南京72小时之内再进行一次核酸检测(两次核酸检测时间间隔24小时以上)(7天2检)。