不是南京户籍不可以申请。

　　新就业人员是指自大中专院校毕业不满5年，在本市有稳定职业的从业人员。申请政府投资建设(筹集)的公共租赁住房保障，应当同时具备下列条件：

　　(一)具有南京户籍;

　　(二)获得大中专院校本科及以上学位证书和毕业证书，毕业未满5年;

　　(三)劳动合同或聘用合同规范、完备，并有稳定收入;

　　(四)在本市连续缴存社会保险和住房公积金1年及以上;

　　(五)本人、配偶及未成年子女在本市无住房。

　　拓展阅读：外来务工人员公租房申请条件

　　外来务工人员申请政府投资建设（筹集）的公共租赁住房保障，应同时具备下列条件：

　　（一）在本市连续缴存社会保险和住房公积金3年及以上;

　　（二）家庭人均年收入低于上一年度本市城市居民人均可支配收入的80%;

　　（三）本人、配偶及未成年子女在本市无住房。

　　在本市务工期间获得市级及以上表彰，职工职业技能竞赛活动市级及以上技术能手称号或竞赛综合成绩前三名，取得技师及以上职业资格证书或高级工资格证书，经市相关部门认定的，在我市连续工作年限、缴存社会保险和住房公积金最低年限放宽至2年。