如果不慎遗失东莞电动车行驶证，是可以进行单独补办的。

　　补办步骤：

　　第一步，车主登录“东莞电动自行车”小程序，下滑至电动自行车车牌补换栏目

　　第二步，选择办理类型后，按系统提示填写相关信息后提交

　　办理“补换行驶证”,需要申请人核实证件信息、资费明细以及选择收货信息，点击确认申请进行支付。车主完成支付，等待后台制证,后台受理制证通过后，后台制证办结，系统发送通知;后台受理制证不通过，系统反馈退回原因，车主重新申办。