1、建立完善的过滤系统： 将氨、氮、硝酸盐消除。包括加强物理过滤，尽量把食物粪便残骸过滤掉，减少有机物被细菌分解成氨和磷酸盐的机会。

2、减少或降低有机物的来源： 包括减少鱼的饲养密度，温度较高或极低时减少喂食。

3、光照要适当： 小球藻在强光会发生强烈的光合作用，快速生长。再加上照明时间过长，一定会爆发绿水。尤其是阳光直射的地方。