1、分布地区不同。

鮰鱼：鮰鱼学名长吻鮠，俗称江团、白吉、肥头鱼、鮠鱼。在分类学上隶属鲶形目、鲿科、鮠属。长吻鮠是我国名贵的淡水鱼类，分布于长江水系，向北可达黄河，向南可至闽江水系。

清江鱼：清江鱼是指产于湖北清江库区的鱼，被誉为“千湖之省”湖北的水产一绝。

2、特征不同。

鮰鱼：长吻鮠鱼体态粗长，腹部膨隆，尾呈侧扁，鮰鱼个体轻重不等，一般为1500~2500克，少数个体可达10公斤。

清江鱼：高蛋白、低脂肪、富含多种维生素和微量元素，是滋补营养佳品。肉质细嫩,肉味肥美,含脂量高,鳔特别肥厚,新鲜时为银白色,干制后为名贵鱼肚。

3、品牌效应不同。

鮰鱼：湖北省石首市所产的“笔架鱼肚”素享盛名。它胶层厚，味纯正，色半透明，制作工艺独特，干制品的外形和镶嵌在鳔内的一个美丽的自然图案，对着光源照看，与屹立在石首市城里的笔架山酷似，由此得名“笔架鱼肚”。

清江鱼：先后获得“中国名牌农产品”、“湖北十大名牌农产品”和第八、九、十届中国农交会金奖，“清江鱼”商标获“湖北著名商标”称号，5种主要的清江鱼品种通过国家有机产品认证。长期以来清江鱼系列产品除俏销国内大中城市中高端水产品市场外，还远销欧、美、日、韩等十多个国家和地区。