1、可以，自建房无产证拆迁也是有补偿的，没房产证的房屋征收属于产权不明且需认定房屋是否合法的建筑，这种房屋征收时需要增加两个程序，
一是由主张这房屋产权的人提出申请主张对这房屋享有产权，如有虚假负法律责任，然后征收人在征收现场及相关媒体公示60天，没有别人主张这房屋的产权就可以认定产权人；
二是，由规划、国土、住建三个部门联合认定该房是否属于违章建筑，如果认定合法建筑，这房屋就可以测量评估计算出补偿金额了。
2、法律依据：《国有土地上房屋征收与补偿条例》 第二条
为了公共利益的需要，征收国有土地上单位、个人的房屋，应当对被征收房屋所有权人给予公平补偿。