1、来源区别:花胶是由石首鱼类或鳗鱼类的鱼鳔加工干制而成；而燕窝是部分雨燕和金丝燕属的几种金丝燕分泌出来的唾液，再混合其他物质所筑成的巢穴。

2、外形区别:花胶整体多为椭圆形，颜色多呈淡黄色，半透明状，表面有较为明显的纹理；燕窝由于品种不同，有白燕、黄燕、红燕之分，市场上比较常见的为白燕，燕窝表面多附有细毛。

3、口感区别:花胶和燕窝中都富含胶质，所以入口都细腻爽滑，但是由于花胶是由鱼鳔制成，所以会有一些海腥味。