1、种植大棚樱桃树比露地管理更为复杂，需要种植户细心，而樱桃树生长快，但是生育期较长，一般种植后需要栽培4-5年才能开花结果，而且产量较低。而这个时间段内，要加强期管理，才能使其多开花结果，很多果农不能等待这个时间，失去了管理的信心，使其任其生长，形成了恶心循环，造成了很多的果树生长不良或死亡。所以要想提高大棚种植樱桃，就要克服这种长时间的等待，要时刻充满信心。
2、根癌是果树中的癌症，它是土壤中的杆菌侵人到根系组织细胞中，引起细胞染色体变异，导致细胞分裂失去控制，形成根疣。这时一种严重危害根系的病害，一旦发作极难防治，直至果树死亡，出现根癌并的另一原因就是购买的苗木带有根癌病菌，或者时栽植土壤中有前茬留下的病菌，此外土壤偏碱也会诱发此病。而大棚的环境更易根癌病菌的生长繁殖，大棚种植比露地种植发生根癌病几率更高，所以一定要注意。
3、在生产中，樱桃大多通过异花授粉，很多樱桃果树不结果的原因就是花期授粉不良导致的。而大棚种植是一个相对封闭的环境，花粉无法借助风力等其他因素进行授粉，往往会出现授粉不良的状况，导致产量低下。所以对于这种情况，要做好人工授粉工作，也可以在棚室内放蜂，通过蜜蜂来辅助授粉。
