1、现在的南京，的确是江苏的省会，而合肥是安徽的省会。

2、朱元璋是安徽人，他建立大明王朝后， 就定都南京， 周边城市称为 南直隶。 后来朱棣造反， 定都北京， 周边叫做北直隶。清兵入关后， 当时叫做江南道， 江南道地方很大，也非常富有， 于是清政府担心有变， 就故意把江南道一分为二， 江宁（当时的南京）+苏州，成为了江苏， 安庆+徽州成为了安徽。

3、但是在康熙后的100年里， 安徽的省会却一直在南京， 而江苏的省会， 却一直在苏州。所以才有了南京历史上是安徽的省会的这个说法。