1、材质不同。喝水杯由无毒的材料制作，如陶瓷，玻璃，不锈钢等制作而成。漱口杯常见为塑料材质，塑料属于高分子化学材料，常含有聚丙乙烯或PVC聚氯乙烯等有毒的化学物质。用塑料水杯饮水，不可避免的用来装热水或开水。当用塑料水杯装热水，特别是装开水时，塑料中有毒的化学物质很容易析入水中的，长期饮用这样的水，必然会对人体造成危害

2、细菌滋生。水杯杯面杯内会有光滑，细腻的釉面。方便日常清洁，不容易滋生细菌。漱口杯易生细菌，且不易洗净。这是因为看似表面光滑的塑料并不光滑，内部微观构造有很多小的孔隙，这些小的空隙易藏污纳垢，并且用常规的方法无法清洗掉。