1、海洋垃圾会被海洋生物所食用，导致海洋生物如某些鸟类胃底不适，食欲下降，导致生育功能的降低甚至导致死亡；除此之外，海洋垃圾还会缠绕在某些海洋生物如鲸类身上，使其无法挣脱严重时甚至致死。

2、海洋垃圾抑制了海洋植物的光合作用，引起其产氧量减少，导致海洋生物的可用氧也随之减少，大大抑制了海洋生物的活动与生命活力。随之而影响的就是整个海洋生态系统，破坏了海洋生态系统的平衡稳态。